武力镇压：二二八事件中的绥靖
3月7日，陈仪下令集合所有武装部队，维护台北市和基隆市的交通和发电厂的安全，并监视处理委员会的活动。
3月8日，福建省的宪兵团2个营搭乘海平轮登陆基隆市，镇压并搜查户口。随后宪兵团进军台北市。晚间，警察和军队在中山堂逮捕和开枪反击处理委员会的参与者，场面混乱。杨亮功搭乘的运兵卡车遭受伏击，圆山陆军仓库前有数百名学生被击毙，台北市的警备总司令部和台湾银行等地也受到扫射。
3月9日，宪兵第二十一团第一营抵达台北市，陈仪宣布台北市和基隆市开始戒严。尽管最初发生零星的攻击事件，但随着援军的增加，镇压行动未遭到强烈反抗并控制住局势。政府在各地展开武力镇压、肃清和报复行动，整编第二十一师军队连续数天从基隆市或高雄市登陆。
3月10日，陈仪宣布全台湾戒严，并下令解散处理委员会及各地分会等非法组织，并逮捕、暗杀处理委员会有关人士或地方绅士阶级。新竹地区也进行绥靖工作，在员树林和虎子山发生小规模武装冲突。
尽管蒋中正命令不得采取报复行动，但陈仪身为最高军事政府长官，并未有效约束军队和警察依法执行绥靖任务。由于台湾过去没有戒严经验，台北市的民众仍然在绥靖期间上学、上班、工作或购买粮食，因为听不懂士兵的口令或语言警告，遭到军队开枪射杀或流弹波及，到处都是尸体。
基隆要塞司令部奉命在基隆市展开绥靖工作，派兵增援金包里的军队，整编第二十一师四三八团第二营从旁协助。基隆要塞司令史宏熹在基隆市、金山乡、社寮岛等地展开扫荡和逮捕，导致港湾遍布被捕杀投海的浮尸，屠杀情况仅次于高雄市。
